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Protozoarios y bacterias pertenecen a diferentes dominios de la vida, los eucariontes y los procariontes, separados por largas edades de la evolución. Sin embargo, como todas las formas de vida en la Tierra, tienen un ancestro común, y por lo tanto tienen intrigantes semejanzas. A pesar de la increíble diversidad tanto de protozoarios como de bacterias, es posible hacer algunas generalizaciones sobre lo que tienen en común.
Código genético
En protistas, bacterias y todos los demás organismos, algunas secuencias de pares de bases químicas de ADN codifican ciertos aminoácidos. Este código es prácticamente universal, en el sentido que la misma secuencia de ADN va a codificar la misma secuencia de aminoácidos tanto en un protozoario como en una bacteria. Excepciones incluyen el hecho de que algunas bacterias utilizan la secuencia UAG para codificar la pirrolisina en lugar de ser un códon de parada, que es lo que ocurre en otros organismos. A pesar de ello, mayoritariamente, el código es una similitud notable entre bacterias y protozoarios.
ribosomas
Tanto las bacterias como los protozoarios primero transcriben su ADN en ARN, y luego traducen ese ARN en una proteína usando estructuras complejas llamadas ribosomas. Una vez más, dividen esa semejanza con todas las demás formas de vida. La estructura de los ribosomas se altera un poco entre bacterias y eucariotas como los protozoarios. Esta diferencia es importante, también, pues algunos antibióticos matan bacterias haciendo el uso de las diferencias entre los ribosomas de eucariotas y bacterias.
Membranas celulares
Tanto bacterias como protozoarios poseen membranas celulares hechas de moléculas llamadas fosfolípidos. Un fosfolípido en una bacteria o protozoario posee un grupo soluble en agua en una punta y una cola insoluble en la otra, entonces las membranas celulares están formadas por una doble capa de estos componentes. La cola está orientada hacia el centro de la doble capa. Las bacterias tienen una pared celular, además de su membrana celular, sin embargo, algunas bacterias poseen membrana interna y externa.
Procesos altamente conservados
Bacterias y protozoarios presentan sorprendentes semejanzas en varios procesos bioquímicos, que también son muy similares a todas las otras formas de vida. El proceso que las bacterias y protozoarios utilizan para romper la glucosa se llama glucólisis. A pesar de tener algunas variaciones, la glucólisis ocurre en casi todos los organismos conocidos. De la misma forma, el proceso de replicación del ADN es muy similar entre bacterias y protozoarios con algunas pequeñas diferencias.